常见多肽数据库-武汉天德生物科技有限公司

序号	名称	简介
1	APD6	https://aps.unmc.edu（不定期更新）。抗菌肽数据库。2025年9月重磅升级至第6版，收录5188条肽序列（天然/合成/预测三类），构建了覆盖"发现—临床转化"全链条的抗菌肽信息管道（AMPIP），支持AI驱动的抗菌肽研发
2	DBAASP	https://www.dbaasp.org/home（每月更新）。抗菌肽结构与功能核心数据库，整合实验测定的抗菌活性、细胞毒性数据及三维结构信息，支持分子动力学模拟数据检索，常被用作机器学习训练集
3	dbAMP 3.0	https://dbamp.ccrb.cuhk.edu.hk/（不定期更新）。大规模抗菌肽数据库，收录33,065条AMP和2,453种抗菌蛋白，集成AMPActiPred（抗菌活性预测）、HemoFinder（溶血毒性预测）等AI工具，支持多靶点MIC定量估算
4	DRAMP 4.0	http://dramp.cput.edu.cn/（不定期更新）。条目类型最多元的抗菌肽数据库之一，收录通用AMP、专利序列（14,739条）和临床候选肽（76条），新增酶解稳定性和抗蛋白酶水解数据，直面临床转化瓶颈
5	Hemolytik	https://hemolytik.raganlab.com/（不定期更新）。溶血毒性专项数据库，手工整理实验验证的溶血与非溶血肽，提供肽的属性、溶血活性及预测结构信息，专用于毒性评估与理性设计
6	IEDB	https://www.iedb.org/（持续更新，NIH资助）。全球规模最大的实验验证T/B细胞表位知识库，收录66,000+抗原的表位数据，覆盖传染病、过敏、自身免疫病及移植领域；2024年发布IEDB-3D 2.0，集成iCn3D三维结构可视化
7	CPPsite 2.0	http://crdd.osdd.net/raghava/cppsite/（不定期更新）。细胞穿透肽（CPP）专项数据库，收录1855条实验验证的CPP（含线性、环状及非天然残基修饰），提供穿透效率、递送货物类型、亚细胞定位等关键参数
8	PeptideAtlas	https://peptideatlas.org/（随大规模数据集发布更新）。蛋白质组学质谱多肽数据库，整合全球实验室的LC-MS/MS数据，通过统一分析流程重新处理原始数据，支持靶向蛋白质组学实验设计与人血浆蛋白组参考集构建
9	THPDB2	http://crdd.osdd.net/raghava/thpdb/（不定期更新）。治疗性多肽药物专项数据库，收录全球获批上市及临床阶段的治疗性多肽，提供药物序列、靶点、适应症及药代动力学信息，为新药设计提供模板
10	TumorHoPe2	https://webs.iiitd.edu.in/raghava/tumorhope2/（不定期更新）。肿瘤靶向多肽数据库，2025年12月升级至第2版，收录1847条实验验证的肿瘤归巢肽（1297条唯一序列），覆盖172种癌细胞系和37种肿瘤类型，提供RESTful API接口
11	BIOPEP- UWM	https://biochemia.uwm.edu.pl/biopep-uwm/（不定期更新）。生物活性多肽综合分析库，收录5000+种具有抗氧化、抗高血压、抗菌、免疫调节等多功能活性的肽段，支持酶解模拟分析和生物活性预测
12	SignalP	https://signalpeptide.de/（不定期维护）。信号肽数据库。专门收集蛋白质N端信号肽序列，用于重组蛋白表达优化和亚细胞定位预测，是蛋白分泌途径研究的基础工具
13	DPL	http://www.peptide-ligand.cn/（不定期更新）。综合性肽配体数据库，收录1044条具有明确结合靶标的肽段，涵盖抗病毒（540条，含SARS-CoV-2）、抗癌、降压、蛋白酶抑制等功能，多数肽-受体复合物具有实验或预测的三维结构